Assessment of ex vivo antimalarial drug efficacy in African Plasmodium falciparum parasite isolates, 2016–2023: a genotype–phenotype association study
2 Brown University
3 BIPAR - Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques
4 Université Paris-Saclay
5 CNR Paludisme - Centre National de Référence Paludisme [AP-HP Hôpital Bichat-Claude Bernard]
6 RITMES - Risques Infectieux Tropicaux et Microorganismes Emergents
7 IHU Marseille - Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection
8 ICAT - SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques
9 IRF - Infections Respiratoires Fongiques
10 Laboratoire de Parasitologie et Mycologiede [CHRU Brest]
11 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
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Résumé
Background: Given the altered responses to both artemisinins and lumefantrine in Eastern Africa, monitoring antimalarial drug resistance in all African countries is paramount. Methods: We measured the susceptibility to six antimalarials using ex vivo growth inhibition assays (IC50) for a total of 805 Plasmodium falciparum isolates obtained from travellers returning to France (2016-2023), mainly from West and Central Africa. Isolates were sequenced using molecular inversion probes (MIPs) targeting forty-three genes across the parasite genome, of which nineteen are drug resistance genes. Findings: Ex vivo susceptibility of all assessed antimalarial compounds was consistent with their potent activity. The median IC50 values for the six drugs were 1.1 nM [IQR: 0.8-1.7] for DHA, 16.7 nM [9.9-27.4] for LMF, 29.5 nM [19.1-45.5] for MFQ, 23.4 nM [17.1-39.0] for MDAQ, 26.7 nM [18.0-41.2] for CQ, and 18.5 nM [15.1-24.3] for PPQ. Only four isolates carried a validated pfkelch13 mutation. Multiple mutations in pfcrt and one in pfmdr1 (Asn86Tyr) were significantly associated with altered susceptibility to multiple drugs, and their frequencies decreased over time. Pfcrt and pfmdr1 mutations altered susceptibility to lumefantrine and mefloquine in an additive manner, with the wild-type haplotype (pfcrt K76-pfmdr1 N86) exhibiting the lowest susceptibility. Interpretation: Our study on P. falciparum isolates from West and Central Africa indicates a low frequency of molecular markers associated with artemisinin resistance and a modest but significant decrease (1.6-2.3X) in the frequency of multidrug resistance markers. These genotypic changes likely mark parasite adaptation to sustained drug pressure and call for intensifying the monitoring of antimalarial drug resistance in Africa.
| Origine | Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte |
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