Active Surveillance Program to Increase Awareness on Invasive Fungal Diseases: the French RESSIF Network (2012 to 2018) - Université d'Angers
Article Dans Une Revue mBio Année : 2022

Active Surveillance Program to Increase Awareness on Invasive Fungal Diseases: the French RESSIF Network (2012 to 2018)

Stéphane Bretagne (1, 2, 3) , Karine Sitbon (1, 3) , Marie Desnos-Ollivier (1, 3) , Dea Garcia-Hermoso (1, 3) , Valérie Letscher-Bru (4) , Sophie Cassaing (5, 6) , Laurence Millon (7) , Florent Morio (8) , Jean-Pierre Gangneux (9) , Lilia Hasseine (10) , Loïc Favennec (11) , Estelle Cateau (12, 13) , Eric Bailly (14) , Maxime Moniot (15) , Julie Bonhomme (16) , Nicole Desbois-Nogard (17) , Taieb Chouaki (18) , André Paugam (19) , Bernard Bouteille (20) , Marc Pihet (21, 22, 23) , Frédéric Dalle (24) , Odile Eloy (25) , Milène Sasso (26) , Magalie Demar (27) , Patricia Mariani-Kurkdjian (28) , Vincent Robert (29) , Olivier Lortholary (1, 3, 30) , Françoise Dromer (1, 3) , The French Mycoses Study Group , Céline Damiani (31) , Hervé Dupont (32) , Julien Maizel (33) , Anne Totet (31) , Jean-Philippe Bouchara (23, 21, 34) , Anne Pauline Bellanger , Ana Berceanu , Jean Christophe Navellou , Emeline Scherer , Philippe Abboud , Christine Aznar , Denis Blanchet , Félix Djossou , Sophie Cayot , Cyril Garrouste , Olivier Lesens , Cécile Moluçon , Céline Nourrisson , Philippe Poirier , Éloïse Bailly , Louise Basmaciyan , Bouhemad Belaid , Mathieu Blot , Denis Caillot , Pierre-Emmanuel Charles , Jean Pierre Quenot , Emmanuelle Amazan , Emilie Baubion , André Cabie , Cyrille Chabartier , Christophe Deligny , Violaine Emal , Olivier Flechelle , Yves Hatchuel , Yohann Le Govic (31) , Harold Merle , Charline Miossec , Jean-Marie Turmel , Ruddy Valentino , Marie-Fleur Durieux , Pascal Turlure , Victor Mercier , Martine Gari-Toussaint , Karine Risso , Loïc Simon , Cedric Bretonnière , David Boutoille , Thomas Gastinne , Karim Lakhal , Elise Launay , Thierry Lepoivre , Pierre Peterlin , Fanny Rialland , Patrice Le Pape , Etienne Canoui , Naima Dahane , Solène Kerneis , Cécile Angebault , Marie-Elisabethh Bougnoux , Nadia Guennouni , Fanny Lanternier , Bennedicte Neven , Mehdi Oualha , Anne Scemla , Emilie Sitterlé , Felipe Suarez , Julie Toubiana , Stéphane Bonacorci , Alexandre Alanio , Anne Bergeron , Blandine Denis , Maud Gits-Muselli , Samia Hamane , Sophie Touratier , Christine Chaumeil , Lilia Merabet , Joelle Claudéon , Elodie Curlier , Valérie Galantine , Jean Claude Gallois , Samuel Markowicz , Muriel Nicolas , Pascal Musson , Kinda Schepers , Alida Minoza , Catherine Kauffmann-Lacroix , Hélène Guégan , Damien Costa , Marion Dehais , Gilles Gargala , Odile Bajolet , Firouze Banisadr , Joel Cousson , Chantal Himberlin , Antoine Huguenin , Dominique Toubas , Pierre Flori , Caroline Mahinc , Hélène Raberin , Julie Denis , Raoul Herbrecht , Paul-Michel Mertes , Fehrat Meziani , Marcela Sabou , Francis Schneider , Anne-Isabelle Bertozzi , Pamela Chauvin , Elena Charpentier , Olivier Cointault , Claire Cottrel , Karen Delavigne , Stanislas Faguer , Judith Fillaux , Emilie Guemas , Xavier Iriart , Lucie Lelièvre , Jean Ruiz , Frédéric Bastides , Adélaïde Chesnay , Guillaume Desoubeaux (35, 36) , Audrey Therby , Elisabeth Chachaty , Bertrand Gachot
1 Mycologie moléculaire - Molecular Mycology
2 AP-HP - Hopital Saint-Louis [AP-HP]
3 CNRMA - Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals
4 DIHP - Dynamique des interactions hôte pathogène
5 CHU Toulouse - Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse
6 RESTORE - Geroscience and rejuvenation research center
7 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
8 IICiMed - Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité - UR 1155
9 Irset - Institut de recherche en santé, environnement et travail
10 CHU Nice - Centre Hospitalier Universitaire de Nice
11 CHU Rouen
12 CHU de Poitiers [La Milétrie] - Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital
13 EBI [Poitiers] - Écologie et biologie des interactions
14 CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
15 CHU Clermont-Ferrand
16 CHU Caen
17 CHU de Martinique - Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique]
18 CHU Amiens-Picardie
19 Hôpital Cochin [AP-HP]
20 CHU Limoges
21 ICAT - SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques
22 Laboratoire de Parasitologie-Mycologie (CHU d'Angers)
23 IRF - Infections Respiratoires Fongiques
24 PAM - Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon]
25 CHV - Centre Hospitalier de Versailles André Mignot
26 MIVEGEC - Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle
27 Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]
28 Hôpital Robert Debré Paris
29 WI - Westerdijk Fungal Biodiversity Institute [Utrecht]
30 Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Necker]
31 AGIR - Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294
32 SSPC - Simplification des soins chez les patients complexes - UR UPJV 7518
33 MP3CV - Mécanismes physiopathologiques et conséquences des calcifications cardiovasculaires - UR UPJV 7517
34 Laboratoire de Parasitologie-Mycologie [CHU Angers]
35 Hôpital Bretonneau
36 CEPR - Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires (CEPR), UMR 1100
Stéphane Bretagne
Mycologie moléculaire - Molecular Mycology
Hopital Saint-Louis [AP-HP]
Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals
Karine Sitbon
  • Fonction : Auteur
Mycologie moléculaire - Molecular Mycology
Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals
Marie Desnos-Ollivier
Mycologie moléculaire - Molecular Mycology
Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals
Dea Garcia-Hermoso
Mycologie moléculaire - Molecular Mycology
Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals
Valérie Letscher-Bru
Dynamique des interactions hôte pathogène
CV
Sophie Cassaing
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse
Geroscience and rejuvenation research center
Laurence Millon
Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
CV
Florent Morio
Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité - UR 1155
CV
Jean-Pierre Gangneux
Institut de recherche en santé, environnement et travail
Lilia Hasseine
  • Fonction : Auteur
Centre Hospitalier Universitaire de Nice
Loïc Favennec
  • Fonction : Auteur
CHU Rouen
Estelle Cateau
Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital
Écologie et biologie des interactions
Eric Bailly
  • Fonction : Auteur
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
Maxime Moniot
  • Fonction : Auteur
CHU Clermont-Ferrand
Julie Bonhomme
  • Fonction : Auteur
CHU Caen
Nicole Desbois-Nogard
  • Fonction : Auteur
Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique]
Taieb Chouaki
CHU Amiens-Picardie
André Paugam
  • Fonction : Auteur
Hôpital Cochin [AP-HP]
Bernard Bouteille
  • Fonction : Auteur
CHU Limoges
Marc Pihet
  • Fonction : Auteur
SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques
Laboratoire de Parasitologie-Mycologie (CHU d'Angers)
Infections Respiratoires Fongiques
Frédéric Dalle
  • Fonction : Auteur
Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon]
Odile Eloy
  • Fonction : Auteur
Centre Hospitalier de Versailles André Mignot
Milène Sasso
Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle
Magalie Demar
Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]
Patricia Mariani-Kurkdjian
  • Fonction : Auteur
Hôpital Robert Debré Paris
Vincent Robert
  • Fonction : Auteur
Westerdijk Fungal Biodiversity Institute [Utrecht]
Olivier Lortholary
  • Fonction : Auteur
Mycologie moléculaire - Molecular Mycology
Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals
Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Necker]
Françoise Dromer
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Mycologie moléculaire - Molecular Mycology
Centre National de Référence Mycoses Invasives et Antifongiques - National Reference Center Invasive Mycoses & Antifungals
The French Mycoses Study Group
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1035501
Céline Damiani
Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294
Hervé Dupont
Simplification des soins chez les patients complexes - UR UPJV 7518
Julien Maizel
Mécanismes physiopathologiques et conséquences des calcifications cardiovasculaires - UR UPJV 7517
Anne Totet
Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294
Jean-Philippe Bouchara
  • Fonction : Auteur
Infections Respiratoires Fongiques
SFR UA 4208 Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques
Laboratoire de Parasitologie-Mycologie [CHU Angers]
Anne Pauline Bellanger
  • Fonction : Auteur
Ana Berceanu
  • Fonction : Auteur
Jean Christophe Navellou
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Emeline Scherer
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Philippe Abboud
  • Fonction : Auteur
Christine Aznar
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Denis Blanchet
Félix Djossou
Sophie Cayot
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Cyril Garrouste
Olivier Lesens
  • Fonction : Auteur
Cécile Moluçon
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Céline Nourrisson
CV
Philippe Poirier
Éloïse Bailly
  • Fonction : Auteur
Louise Basmaciyan
Bouhemad Belaid
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Mathieu Blot
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Denis Caillot
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Pierre-Emmanuel Charles
  • Fonction : Auteur
Jean Pierre Quenot
Emmanuelle Amazan
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Emilie Baubion
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André Cabie
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Cyrille Chabartier
  • Fonction : Auteur
Christophe Deligny
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Violaine Emal
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Olivier Flechelle
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Yves Hatchuel
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Yohann Le Govic
Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294
Harold Merle
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Charline Miossec
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Jean-Marie Turmel
  • Fonction : Auteur
Ruddy Valentino
  • Fonction : Auteur
Marie-Fleur Durieux
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Pascal Turlure
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Victor Mercier
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Martine Gari-Toussaint
  • Fonction : Auteur
Karine Risso
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Loïc Simon
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Cedric Bretonnière
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David Boutoille
Thomas Gastinne
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Karim Lakhal
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Elise Launay
Thierry Lepoivre
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Pierre Peterlin
Fanny Rialland
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Patrice Le Pape
Etienne Canoui
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Naima Dahane
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Solène Kerneis
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Cécile Angebault
Marie-Elisabethh Bougnoux
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Nadia Guennouni
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Fanny Lanternier
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Bennedicte Neven
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Mehdi Oualha
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Anne Scemla
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Emilie Sitterlé
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Felipe Suarez
Julie Toubiana
Stéphane Bonacorci
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Alexandre Alanio
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Anne Bergeron
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Blandine Denis
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Maud Gits-Muselli
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Samia Hamane
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Sophie Touratier
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Christine Chaumeil
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Lilia Merabet
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Joelle Claudéon
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Elodie Curlier
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Valérie Galantine
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Jean Claude Gallois
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Samuel Markowicz
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Muriel Nicolas
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Pascal Musson
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Kinda Schepers
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Alida Minoza
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Catherine Kauffmann-Lacroix
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Hélène Guégan
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Damien Costa
CV
Marion Dehais
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Gilles Gargala
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Odile Bajolet
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Firouze Banisadr
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Joel Cousson
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Chantal Himberlin
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Antoine Huguenin
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Dominique Toubas
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Pierre Flori
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Caroline Mahinc
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Hélène Raberin
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Julie Denis
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Raoul Herbrecht
Paul-Michel Mertes
Fehrat Meziani
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Marcela Sabou
  • Fonction : Auteur
Francis Schneider
Anne-Isabelle Bertozzi
  • Fonction : Auteur
Pamela Chauvin
  • Fonction : Auteur
Elena Charpentier
  • Fonction : Auteur
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Olivier Cointault
  • Fonction : Auteur
Claire Cottrel
  • Fonction : Auteur
Karen Delavigne
  • Fonction : Auteur
Stanislas Faguer
Judith Fillaux
  • Fonction : Auteur
Emilie Guemas
  • Fonction : Auteur
Xavier Iriart
Lucie Lelièvre
  • Fonction : Auteur
Jean Ruiz
  • Fonction : Auteur
Frédéric Bastides
  • Fonction : Auteur
Adélaïde Chesnay
Guillaume Desoubeaux
Hôpital Bretonneau
Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires (CEPR), UMR 1100
Audrey Therby
  • Fonction : Auteur
Elisabeth Chachaty
  • Fonction : Auteur
Bertrand Gachot
  • Fonction : Auteur

Résumé

The French National Reference Center for Invasive Mycoses and Antifungals leads an active and sustained nationwide surveillance program on probable and proven invasive fungal diseases (IFDs) to determine their epidemiology in France. Between 2012 and 2018, a total of 10,886 IFDs were recorded. The incidence increased slightly over time (2.16 to 2.36/10,000 hospitalization days, P = 0.0562) in relation with an increase of fungemia incidence (1.03 to 1.19/10,000, P = 0.0023), while that of other IFDs remained stable. The proportion of ≥65-year-old patients increased from 38.4% to 45.3% (P < 0.0001). Yeast fungemia (n = 5,444) was due mainly to Candida albicans (55.6%) with stable proportions of species over time. Echinocandins became the main drug prescribed (46.7% to 61.8%), but global mortality rate remained unchanged (36.3% at 1 month). Pneumocystis jirovecii pneumonia (n = 2,106) was diagnosed mostly in HIV-negative patients (80.7%) with a significantly higher mortality than in HIV-positive patients (21.9% versus 5.4% at 1 month, P < 0.0001). Invasive aspergillosis (n = 1,661) and mucormycosis (n = 314) were diagnosed mostly in hematology (>60% of the cases) with a global mortality rate of 42.5% and 59.3%, respectively, at 3 months and significant changes in diagnosis procedure over time. More concurrent infections were also diagnosed over time (from 5.4% to 9.4% for mold IFDs, P = 0.0115). In conclusion, we observed an aging of patients with IFD with a significant increase in incidence only for yeast fungemia, a trend toward more concurrent infections, which raises diagnostic and therapeutic issues. Overall, global survival associated with IFDs has not improved despite updated guidelines and new diagnostic tools. IMPORTANCE The epidemiology of invasive fungal diseases (IFDs) is hard to delineate given the difficulties in ascertaining the diagnosis that is often based on the confrontation of clinical and microbiological criteria. The present report underlines the interest of active surveillance involving mycologists and clinicians to describe the global incidence and that of the main IFDs. Globally, although the incidence of Pneumocystis pneumonia, invasive aspergillosis, and mucormycosis remained stable over the study period (2012 to 2018), that of yeast fungemia increased slightly. We also show here that IFDs seem to affect older people more frequently. The most worrisome observation is the lack of improvement in the global survival rate associated with IFDs despite the increasing use of more sensitive diagnostic tools, the availability of new antifungal drugs very active in clinical trials, and a still low/marginal rate of acquired in vitro resistance in France. Therefore, other tracks of improvement should be investigated actively.

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Sciences du Vivant [q-bio] Microbiologie et Parasitologie Mycologie
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Soumis le : mercredi 4 mai 2022-13:32:21

Dernière modification le : vendredi 13 décembre 2024-15:14:39

Archivage à long terme le : vendredi 5 août 2022-18:36:43

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Dates et versions

hal-03658122 , version 1 (04-05-2022)

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Paternité

Identifiants

Citer

Stéphane Bretagne, Karine Sitbon, Marie Desnos-Ollivier, Dea Garcia-Hermoso, Valérie Letscher-Bru, et al.. Active Surveillance Program to Increase Awareness on Invasive Fungal Diseases: the French RESSIF Network (2012 to 2018). mBio, 2022, 13 (3), pp.e0092022. ⟨10.1128/mbio.00920-22⟩. ⟨hal-03658122⟩

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