Thèse Année : 2024

Genomic diversity of invasive micromycetes in transplant recipients : value of analysis of the gene encoding Pneumocystis jirovecii inosine 5' monophosphate dehydrogenase as a circulating marker

Diversité génomique de Pneumocystis jirovecii chez les greffés/transplantés : intérêt de l'analyse du gène codant pour l'inosine 5' monophosphate déshydrogénase en tant que marqueur de circulation

Claire Hoffmann
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  • PersonId : 1537266
  • IdRef : 252637704

Résumé

For about ten years, there has been an increase in Pneumocystis pneumonia (PCP) cases in solid organ transplant (SOT) recipients. This may be due to anti-rejection treatments render it the patients more susceptible to opportunistic infections including PCP. Mycophenolic acid (MPA) is one of the most widely used molecules in this anti-rejection treatment. MPA has an antifungal action on Aspergillus sp., Rhodotorula and Cryptococcus and may have an action on Pneumocystis. The selection pressure in microbiology is well known and in this context, we hypothesized that the increase in cases of PCP in could be linked to specific strains of Pneumocystis selected under MPA pressure. We characterized the inosine 5'-monophosphate dehydrogenase (impdh) gene, a target enzyme of MPA, in Pneumocystis from SOT recipients treated or not treated with MPA, and a control group of non-SOT recipients not treated with MPA. A mutation, Ala261Thr, was found in 69% of the SOT recipient group and was not observed in the control group. In addition, 65.5% of the SOT recipient group had the same multilocus genotype, MLG-31, which was not found in the control group. These results support the presence of a specific strain of Pneumocystis in the SOT recipients selected under MPA pressure. A second mutation, Ala261Ser, was also only found in the SOT recipients. These two mutations are similar to those described in other fungi naturally resistant to MPA. The analysis of impdh gene represents a new marker of circulation of Pneumocystis in infected populations, particularly SOT recipients.

Depuis une dizaine d’années une augmentation de l’incidence des cas de pneumonie à Pneumocystis (PPC) a été observée chez les patients transplantés d’organe solide. Cette augmentation de cas pourrait être due au traitement anti-rejet rendant le patient plus sensible aux infections opportunistes dont la PPC. L’acide mycophénolique (MPA) est une des molécules les plus utilisées dans ce traitement antirejet. Le MPA présente une action antifongique sur d’Aspergillus sp, de Rhodotorula ou encore de Cryptococcus et pourrait avoir une action sur Pneumocystis. La pression de sélection en microbiologie étant bien connue et dans ce contexte nous avons posé l’hypothèse que l’augmentation des cas de PPC chez les pouvait être liée à des souches spécifiques de Pneumocysytis sélectionnées sous pression du MPA. Nous avons caractérisé le gène de l’inosine 5’-monophosphate déshydrogénase (impdh), enzyme cible du MPA, chez Pneumocystis provenant de patients transplantés traités ou non traités par MPA et un groupe contrôle de patients non transplantés non traités par MPA. Une mutation, Ala261Thr a été retrouvée chez 69% du groupe de transplantés et n’a pas été observée dans le groupe contrôle. De plus, 65,5% du groupe des transplantés présente le même génotype multilocus, le MLG-31, qui n’a pas été retrouvé dans le groupe contrôle. Ce résultat est en faveur de la présence d’une souche spécifique de Pneumocystis chez les transplantés sous pression de sélection du MPA. Une seconde mutation, Ala261Ser a également été uniquement retrouvée dans les transplantés. Ces deux mutations, sont analogues à celles décrites chez d’autres champignons naturellement résistants au MPA. L’analyse de l’impdh représente ainsi un nouveau marqueur de circulation de Pneumocystis dans les populations infectées en particulier les patients transplantés.

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Citer

Claire Hoffmann. Diversité génomique de Pneumocystis jirovecii chez les greffés/transplantés : intérêt de l'analyse du gène codant pour l'inosine 5' monophosphate déshydrogénase en tant que marqueur de circulation. Microbiologie et Parasitologie. Université de Bretagne occidentale - Brest, 2024. Français. ⟨NNT : 2024BRES0106⟩. ⟨tel-05052060⟩
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